18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2832 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2832  hypothetical protein  100 
 
 		 1131 aa  2233    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2567  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1141 aa  353  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1941  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1140 aa  313  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1249 aa  311  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1127  tetratricopeptide TPR_4 protein  26.41 
 
 		 1247 aa  271  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.541599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1389  tetratricopeptide TPR_4 protein  29.19 
 
 		 1269 aa  271  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.184088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4414  tetratricopeptide TPR_4 protein  28.46 
 
 		 1242 aa  262  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746828  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1690  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1280 aa  258  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16649  normal  0.0936113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1437  tetratricopeptide TPR_4  29.05 
 
 		 959 aa  246  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3780  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1306 aa  244  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5048  tetratricopeptide TPR_4 protein  29.42 
 
 		 1127 aa  207  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0500  tetratricopeptide TPR_4 protein  27.22 
 
 		 1112 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0931337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5541  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 1118 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0429  tetratricopeptide TPR_4 protein  30.47 
 
 		 1116 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0463  tetratricopeptide TPR_4 protein  29.64 
 
 		 1108 aa  179  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5158  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1157 aa  178  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3446  hypothetical protein  23.88 
 
 		 860 aa  56.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1261 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>