17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1389 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3780  hypothetical protein  62.27 
 
 		 1306 aa  978    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  56.39 
 
 		 1261 aa  1343    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1690  hypothetical protein  61.62 
 
 		 1280 aa  979    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16649  normal  0.0936113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1389  tetratricopeptide TPR_4 protein  100 
 
 		 1269 aa  2514    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.184088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  56.66 
 
 		 1249 aa  1338    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1127  tetratricopeptide TPR_4 protein  77.25 
 
 		 1247 aa  1776    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.541599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4414  tetratricopeptide TPR_4 protein  55.24 
 
 		 1242 aa  1253    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0500  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.65 
 
 		 1112 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0931337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5541  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 1118 aa  373  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0463  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.75 
 
 		 1108 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0429  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.98 
 
 		 1116 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2567  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1141 aa  370  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5048  tetratricopeptide TPR_4 protein  33.67 
 
 		 1127 aa  361  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5158  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 1157 aa  358  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1941  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1140 aa  357  7.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1437  tetratricopeptide TPR_4  31.46 
 
 		 959 aa  355  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2832  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1131 aa  244  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>