43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4829 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  100 
 
 		 5185 aa  10450    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  46.82 
 
 		 9529 aa  231  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  48 
 
 		 926 aa  102  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  40.54 
 
 		 630 aa  99.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  42.31 
 
 		 423 aa  87  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  41.04 
 
 		 489 aa  85.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  28.89 
 
 		 570 aa  82.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  28.63 
 
 		 718 aa  82.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  37.76 
 
 		 484 aa  82.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  28.35 
 
 		 524 aa  81.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  27.1 
 
 		 524 aa  81.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  22.35 
 
 		 602 aa  81.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  25.38 
 
 		 575 aa  79.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  28.82 
 
 		 488 aa  78.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  27.07 
 
 		 3677 aa  78.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  25.45 
 
 		 548 aa  75.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  45.78 
 
 		 1261 aa  68.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  25.23 
 
 		 1088 aa  68.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  27.41 
 
 		 440 aa  65.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  27.41 
 
 		 440 aa  65.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  54.55 
 
 		 332 aa  63.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  39.78 
 
 		 444 aa  62.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1197 aa  62  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  24.35 
 
 		 3754 aa  58.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  20.94 
 
 		 966 aa  57.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1465 aa  57.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0454  hypothetical protein  28.17 
 
 		 744 aa  57.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1440  hypothetical protein  28.68 
 
 		 299 aa  55.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386026  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4350  hypothetical protein  31.07 
 
 		 936 aa  54.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709534  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  30.77 
 
 		 897 aa  54.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2116  hypothetical protein  29.63 
 
 		 265 aa  54.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.292016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  30.43 
 
 		 1112 aa  54.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67289  Spliced mRNA and Cell cycle regulated gene  24.54 
 
 		 798 aa  53.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  41.76 
 
 		 776 aa  52.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3325  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 283 aa  52.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2525  hypothetical protein  22.55 
 
 		 2247 aa  51.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  37.9 
 
 		 501 aa  50.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  32.61 
 
 		 3521 aa  50.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  32.17 
 
 		 344 aa  48.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  43.68 
 
 		 368 aa  48.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.08 
 
 		 602 aa  48.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1714  hypothetical protein  21.14 
 
 		 891 aa  47.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2004  ferric-uptake regulator  24.06 
 
 		 483 aa  47  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>