160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5311 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  83.97 
 
 		 586 aa  892    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  83.28 
 
 		 590 aa  881    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 602 aa  1187    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  70.48 
 
 		 595 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.58 
 
 		 540 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  67.01 
 
 		 545 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  46.63 
 
 		 419 aa  326  9e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.78 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.52 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.52 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.04 
 
 		 456 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.4 
 
 		 432 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.29 
 
 		 434 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.17 
 
 		 447 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  43.41 
 
 		 433 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  43.41 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.59 
 
 		 433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.04 
 
 		 426 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.96 
 
 		 443 aa  301  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.32 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.33 
 
 		 433 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  40.88 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.83 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 559 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.22 
 
 		 565 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  35.21 
 
 		 546 aa  219  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  35.19 
 
 		 563 aa  211  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.59 
 
 		 560 aa  208  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  37.98 
 
 		 564 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  36.15 
 
 		 598 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  34.47 
 
 		 546 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.47 
 
 		 546 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 549 aa  200  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.8 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.14 
 
 		 547 aa  198  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 526 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  35.92 
 
 		 563 aa  196  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.07 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.1 
 
 		 549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  34.23 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.62 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.04 
 
 		 599 aa  188  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  33.63 
 
 		 571 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 625 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.46 
 
 		 525 aa  187  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 560 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 560 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  34.63 
 
 		 536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 668 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  35.03 
 
 		 557 aa  183  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.05 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  34.74 
 
 		 656 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 560 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  35.74 
 
 		 596 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  35.74 
 
 		 618 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  35.74 
 
 		 618 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  36.45 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  36.27 
 
 		 576 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  37.07 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.07 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  37.07 
 
 		 611 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  35.91 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  37.07 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  37.07 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  37.07 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  37.07 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  37.07 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.42 
 
 		 540 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  37.07 
 
 		 615 aa  178  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.13 
 
 		 543 aa  178  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  35.91 
 
 		 615 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  35.91 
 
 		 606 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  35.91 
 
 		 615 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  34.02 
 
 		 572 aa  177  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  35.96 
 
 		 616 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  31.94 
 
 		 483 aa  177  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  33.15 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  35.38 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  34.44 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.02 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.17 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  35.19 
 
 		 318 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.98 
 
 		 672 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  32.36 
 
 		 614 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.43 
 
 		 636 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 516 aa  171  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  35.27 
 
 		 607 aa  170  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  33.79 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  30.9 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  30.29 
 
 		 540 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.7 
 
 		 461 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  32.44 
 
 		 561 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  31 
 
 		 521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 521 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.59 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>