50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0352 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0352  sporulation related  100 
 
 
265 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000773302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  32.08 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.08 
 
 
2449 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  36.62 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  26.18 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  27.63 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  34.75 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  30.99 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  36.49 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  29.63 
 
 
292 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  35.62 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  29.63 
 
 
301 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  29.63 
 
 
298 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  29.63 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  36.49 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  31.13 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  36.49 
 
 
211 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  27.08 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  28.16 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  29.52 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  26.67 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  33.8 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  35.21 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0819  Sporulation domain protein  35.82 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.427345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  29.89 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  27.38 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  27.38 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  35.21 
 
 
229 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  27.38 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  27.38 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  27.38 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  27.38 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  30.56 
 
 
198 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  27.38 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  27.4 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  29.77 
 
 
349 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  28.77 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  35.21 
 
 
208 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  27.27 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  30 
 
 
360 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  33.72 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  33.8 
 
 
218 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  28.07 
 
 
260 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  28.77 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  28.77 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.11 
 
 
1888 aa  42.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  28.77 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  29.58 
 
 
303 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 
222 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  30.25 
 
 
231 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>