160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0774 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  100 
 
 		 211 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  63.51 
 
 		 218 aa  235  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  60.93 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  58.14 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  59.63 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  53.99 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  49.38 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  54.39 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  49.07 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  44.44 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  35.44 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  34.62 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  34.91 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  33.33 
 
 		 260 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  34.48 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  35.55 
 
 		 265 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  35.14 
 
 		 274 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  34.9 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  62.5 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  52 
 
 		 286 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  52 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  52 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  52 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  53.33 
 
 		 292 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  52 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  52 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  52 
 
 		 286 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  52 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  53.33 
 
 		 298 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  53.33 
 
 		 295 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  53.33 
 
 		 301 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  53.33 
 
 		 297 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  53.33 
 
 		 297 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  53.33 
 
 		 301 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  36.54 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  29.95 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  39.74 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  29.21 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  40.28 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  32.88 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  41.56 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  39.73 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  40 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  37.97 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  35.87 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  42.25 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  32.14 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  30.1 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  36.11 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  37.5 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  30.65 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  30.86 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  42.25 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  34.72 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  33.75 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  34.25 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  35.71 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  36.11 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  34.25 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  35 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  34.72 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  26.35 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  31.47 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  31.47 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  30.14 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  31.47 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  31.47 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  31.47 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  29.14 
 
 		 319 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  29.14 
 
 		 319 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  29.14 
 
 		 319 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  38.24 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1943  sporulation related protein  38.14 
 
 		 303 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.932522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  34.29 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  34.57 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  37.84 
 
 		 328 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  37.84 
 
 		 334 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  37.84 
 
 		 324 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  37.84 
 
 		 325 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  34.29 
 
 		 281 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  34.29 
 
 		 281 aa  48.5  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  28.07 
 
 		 312 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  37.84 
 
 		 324 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  39.8 
 
 		 256 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  35.62 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1124  cell division protein FtsN  32.99 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.1824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  32.86 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  34.29 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  36.62 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  36 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  29.63 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  37.31 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  34.43 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  34.57 
 
 		 352 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>