43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2282 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  100 
 
 		 256 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  90.23 
 
 		 256 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2303  sporulation domain-containing protein  38.52 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00342773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  39.44 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1435  sporulation-related protein  35.42 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.419741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1018  sporulation domain-containing protein  35.19 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0660774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1136  Sporulation domain protein  47.89 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  29.05 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  34.38 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3376  Sporulation domain protein  40.62 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  30.2 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  29.01 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  31.09 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  34.69 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  29.89 
 
 		 177 aa  48.9  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  28 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  25.12 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  41.54 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  34.78 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  29.08 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  32.48 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  27.21 
 
 		 186 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  41.94 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  25.23 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  28.35 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  30.21 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  33.87 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  29.69 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  27.05 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  26.98 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  29.69 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  29.47 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  36.76 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  29.69 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  34.67 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  36.51 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  27.75 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  25.93 
 
 		 205 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  29.73 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  25.93 
 
 		 203 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  26.92 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  37.21 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 		 218 aa  42  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>