56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0743 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  474  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  31.1 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1435  sporulation-related protein  30.49 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.419741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1018  sporulation domain-containing protein  32.32 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0660774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2303  sporulation domain-containing protein  25.93 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00342773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  31.05 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  41.33 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  33.06 
 
 		 740 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  37.5 
 
 		 545 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  36.23 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  30.38 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  36.89 
 
 		 535 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  35.19 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  30.11 
 
 		 177 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  35.45 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  39.53 
 
 		 505 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  29.37 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3214  sporulation domain-containing protein  36.92 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  33.98 
 
 		 480 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2287  sporulation domain-containing protein  33.02 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.197916  normal  0.660885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  34.67 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  24.22 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  36 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  34.69 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  33.06 
 
 		 529 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  38.67 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  30.7 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 		 709 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  38.1 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  39.06 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  32.47 
 
 		 176 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  34.88 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2296  hypothetical protein  36.47 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906351  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  28.79 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  28.79 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  38.03 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  36 
 
 		 481 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  36.67 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  28.03 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  33.33 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  32.97 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  32.17 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  38.16 
 
 		 470 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  28.32 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  32.88 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  38.6 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  32.39 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  38.6 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  38.6 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  38.6 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  26.39 
 
 		 192 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  30.23 
 
 		 185 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  34.21 
 
 		 328 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  31.71 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  25.25 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>