107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1976 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  80.39 
 
 		 202 aa  301  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  34.5 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  32.72 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  33.95 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  30.08 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  32 
 
 		 236 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  33.18 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  30.97 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  31.16 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  31.56 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  28.28 
 
 		 260 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  37.5 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  31.88 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  30.77 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  28.3 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  33.17 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  39.29 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  40.45 
 
 		 282 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  40.45 
 
 		 282 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  40.45 
 
 		 282 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  40.45 
 
 		 282 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  40.45 
 
 		 286 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  40.45 
 
 		 286 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  40.45 
 
 		 282 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  40 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  38.67 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  38.67 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  29.5 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  41.89 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  39.56 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  33.96 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  31.58 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  36.99 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  38.89 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  33.33 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  35.62 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  29.11 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  26.6 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  33.64 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  32.58 
 
 		 249 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0348  Sporulation domain protein  38.57 
 
 		 277 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647009  normal  0.768364 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0168  hypothetical protein  38.57 
 
 		 296 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  40 
 
 		 176 aa  51.6  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  24.21 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  32.62 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  32.62 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  32.62 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  30.21 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  23.96 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  24.21 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  31.94 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  25.26 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  25.26 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  25.26 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  35.53 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  30.3 
 
 		 264 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  29.9 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 		 279 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  29.9 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  28 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  30.38 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  30.99 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  27.27 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  30.38 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  27.7 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  30.67 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  29.33 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  25.56 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  28.21 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  29.17 
 
 		 238 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  28.38 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  31.82 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  28.74 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0005  cell division protein FtsN  31.62 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  35.14 
 
 		 471 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  29 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  29.51 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  32.79 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  23.62 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  31.4 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  28.95 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  31.75 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  26.88 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  35.82 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>