121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5140 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  97.41 
 
 		 232 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  97.41 
 
 		 232 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  94.83 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  80.75 
 
 		 238 aa  353  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  75.76 
 
 		 231 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  74.03 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  63.87 
 
 		 231 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  66.81 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  62.45 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  59.83 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  31.08 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  32.46 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  33.93 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  31.2 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  29.74 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  30.83 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  34.3 
 
 		 201 aa  85.1  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  27.04 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  30.62 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  34.02 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  28.82 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  29.74 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  37.66 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  27.54 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  32.64 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  27.15 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  32.45 
 
 		 257 aa  62  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  37.8 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  37.8 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  37.04 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  37.8 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  37.8 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  37.8 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  37.8 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  37.8 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  37.8 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  39.73 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  41.1 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  39.73 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  37.8 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  37.8 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  37.8 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  37.8 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  37.8 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  37.8 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  39.73 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  31.13 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  41.03 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  35.53 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  30.72 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  35.53 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  26.7 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  26.7 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  26.7 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  36.96 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  24.34 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  34.21 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  26.21 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  31.71 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1945  hypothetical protein  24.46 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.749075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  31.94 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  26.22 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  31.17 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  27.87 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  29.58 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  31.17 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  37.5 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  30.69 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  33.33 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  30.37 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  24.12 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  30 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  29.87 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  30.88 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  30.88 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  22.61 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  46.94 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  23.68 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  23.68 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  23.68 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  32.12 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  29.87 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  35.71 
 
 		 176 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  23.81 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  32.05 
 
 		 312 aa  49.3  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  50 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  29.03 
 
 		 319 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  29.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  29.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  29.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  29.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  29.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  29.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  29.27 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>