43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2238 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1945  hypothetical protein  90.53 
 
 
259 aa  480  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.749075  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  49.46 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  30.39 
 
 
186 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  23.64 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  23.3 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  25.53 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  25.53 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  23.37 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  23.66 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  30.37 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  33.33 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  35 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  35 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  31.58 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  34.25 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  32.95 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  30.26 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  22.39 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  32.88 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  31.58 
 
 
232 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  31.51 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  31.51 
 
 
238 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  25 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  34.29 
 
 
207 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  29.75 
 
 
194 aa  45.4  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  21.13 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  21.13 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  21.13 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  21.13 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  21.13 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  21.13 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  22.57 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  30.67 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  30 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  28.95 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  35.21 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  35.21 
 
 
281 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
229 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  35.21 
 
 
281 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  26.47 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  29.33 
 
 
198 aa  42  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>