More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2221 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  35.32 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 134 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 128 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  31.28 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 124 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  44.83 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  43.64 
 
 		 124 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 203 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 214 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  43.64 
 
 		 124 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 165 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  44.74 
 
 		 155 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  40.13 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 202 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  43.36 
 
 		 145 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  31.96 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 157 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 145 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  43.64 
 
 		 124 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  45.28 
 
 		 122 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 360 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 360 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 163 aa  105  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 144 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  50.54 
 
 		 153 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  36.08 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  48.45 
 
 		 171 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  31.6 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  49.5 
 
 		 125 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  53.26 
 
 		 125 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  44.35 
 
 		 127 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  30.73 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  32.81 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  31.9 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  30.77 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  32.13 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 199 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  32.47 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  44.34 
 
 		 181 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  52.22 
 
 		 227 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 200 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 162 aa  101  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  34.54 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  34.54 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  49.44 
 
 		 171 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 150 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  50 
 
 		 127 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 119 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  34.54 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 124 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  31.36 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  38.59 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 114 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 140 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  31.36 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  46.94 
 
 		 163 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 335 aa  99.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  47.31 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  49.46 
 
 		 123 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 179 aa  99.4  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  49.44 
 
 		 142 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  36.42 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 213 aa  99  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 200 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 324 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  44.64 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  32.11 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  33.02 
 
 		 295 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 367 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  32.51 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  29.57 
 
 		 341 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 358 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  30.17 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 303 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 162 aa  96.3  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  44.21 
 
 		 170 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  32.61 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>