118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0398 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  100 
 
 
238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  80.75 
 
 
232 aa  344  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  79.92 
 
 
232 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  79.92 
 
 
232 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  80.75 
 
 
232 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  79.41 
 
 
231 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  79.41 
 
 
231 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  59.26 
 
 
231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  63.6 
 
 
224 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  58.26 
 
 
230 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  55.56 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  30.93 
 
 
186 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  30.13 
 
 
202 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  30.91 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  30.17 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  32.11 
 
 
201 aa  85.1  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  34.76 
 
 
222 aa  85.5  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  30.21 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  30.13 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  29.44 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  23.43 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  32.53 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  30 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  27.63 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  36.49 
 
 
293 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  32.5 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  26.61 
 
 
207 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  30.82 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  37.8 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  33.33 
 
 
286 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  33.33 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  38.24 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  33.78 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  32.88 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  35.14 
 
 
301 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
295 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
298 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  28.17 
 
 
177 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  35.14 
 
 
297 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
297 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  29.38 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  25.68 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  27.69 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1945  hypothetical protein  24.03 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.749075  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  27.49 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  27.49 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  27.49 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  31.46 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  24.05 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  29.58 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  31.46 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  30.56 
 
 
260 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  28.69 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  31.58 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  31.08 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  32.47 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  24.03 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  34.72 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  31.58 
 
 
319 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  22.86 
 
 
213 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  26.97 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  38.57 
 
 
176 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  32.81 
 
 
198 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  29.58 
 
 
279 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  33.33 
 
 
312 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  29.76 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  26.97 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  30.99 
 
 
319 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  25.71 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  30.99 
 
 
319 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  31.94 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  30.99 
 
 
319 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  30.99 
 
 
319 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  30.99 
 
 
319 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  30.99 
 
 
319 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  30.99 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  30.56 
 
 
231 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  30.56 
 
 
231 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  30.56 
 
 
231 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  42.86 
 
 
289 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  30.99 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  34.15 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  29.58 
 
 
328 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  29.58 
 
 
325 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  29.58 
 
 
334 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  29.58 
 
 
324 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  27.14 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  29.58 
 
 
324 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 
188 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>