121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0375 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  94.83 
 
 
232 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  93.53 
 
 
232 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  93.53 
 
 
232 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  80.75 
 
 
238 aa  354  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  75.32 
 
 
231 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  73.59 
 
 
231 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  62.61 
 
 
231 aa  284  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  65.09 
 
 
224 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  62.45 
 
 
230 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  33.19 
 
 
186 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  29.73 
 
 
202 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  57.45 
 
 
264 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  30.77 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  31.02 
 
 
194 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  36 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  31.93 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  29.13 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  33.12 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  27.12 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  28.63 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  27.54 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  37.66 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  30.14 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  32.64 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  33.11 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  31.79 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  36.59 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  36.59 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  36.59 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  36.59 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  36.59 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  36.59 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  28.05 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  39.73 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  36.59 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  38.36 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  35.8 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  38.89 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  38.36 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
303 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  38.36 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  36.59 
 
 
301 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  36.59 
 
 
295 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  36.59 
 
 
292 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  36.59 
 
 
298 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  36.59 
 
 
301 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  36.59 
 
 
297 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  36.59 
 
 
297 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  29.33 
 
 
177 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  35.37 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  34.21 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  32.93 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  29.57 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  27.32 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  30.17 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  25.09 
 
 
275 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  33.33 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  23.01 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  34.83 
 
 
213 aa  55.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  28.69 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1945  hypothetical protein  24.28 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.749075  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  30.99 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  23.65 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  23.65 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  23.65 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  31.25 
 
 
279 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  22.12 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  29.55 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  32.85 
 
 
281 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  32.85 
 
 
281 aa  52  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  30.85 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  36.11 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  23.93 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  21.68 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  29.87 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  24.76 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  32.29 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  23.41 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  23.81 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  37.5 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  33.77 
 
 
312 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  31.17 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  22.07 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  44.9 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  36.67 
 
 
254 aa  48.9  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  31.94 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  47.92 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  24.6 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  31 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 
188 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  35.09 
 
 
709 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  26.79 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  31.51 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  30.99 
 
 
319 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  30.99 
 
 
319 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>