113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4229 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  47.85 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  52.04 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  46.54 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  44.91 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  46.98 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  44.65 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  44.26 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  38.49 
 
 		 289 aa  138  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  43.9 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  33.72 
 
 		 265 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  35.42 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  31.76 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  34.93 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  36.21 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  56.41 
 
 		 245 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  28.24 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  44.74 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  42.11 
 
 		 282 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  42.11 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  42.11 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  42.11 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  42.11 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  42.11 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  42.11 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  42.11 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  42.11 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  42.11 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  42.11 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  42.11 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  42.11 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  42.11 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  42.11 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  29.2 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  35.53 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  35.07 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  35.07 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  35.07 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  39.19 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  36.11 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  25 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  39.78 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  36.71 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  42.22 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  33.73 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  32.35 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  25 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  31.58 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  33.8 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  37.63 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  29.79 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  35.44 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  34.07 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  34.62 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  34.62 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  44.78 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  27.72 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  38.1 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  37.5 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  28.1 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  42.03 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  32.14 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  29.87 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  44.93 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  34.44 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  36.56 
 
 		 285 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  38.89 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  27.27 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  34.48 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  27.27 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  32.97 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  37.5 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  25.35 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  31.67 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1943  sporulation related protein  32.33 
 
 		 303 aa  45.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.932522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  32.1 
 
 		 280 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  35 
 
 		 144 aa  45.4  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  25.13 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  33.33 
 
 		 279 aa  45.1  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  34.15 
 
 		 268 aa  45.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  36.23 
 
 		 315 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  26.76 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0705  sporulation domain-containing protein  37.31 
 
 		 372 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3497  sporulation domain-containing protein  44.93 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  38.71 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  31.67 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  30.51 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  23.08 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  23.08 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0924  sporulation domain protein  33.8 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  23.08 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  23.08 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  28.44 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0549  hypothetical protein  31.91 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>