More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1255 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  100 
 
 		 320 aa  629  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  44.37 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1943  sporulation related protein  43.28 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.932522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  58.82 
 
 		 185 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  36.04 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  34.4 
 
 		 282 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  31.65 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  43.33 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  34.67 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  31 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  31.05 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  34.17 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  34.89 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  46.34 
 
 		 224 aa  120  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  35.56 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  31.44 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  32.33 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  35.19 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  32.33 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  32.42 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  42.51 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  44.29 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  44.67 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  31.6 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  33.7 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  40.93 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  34.3 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  50 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  50.45 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  40.27 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  44.16 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  43.9 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  33.33 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  47.79 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  50.45 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  35.55 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  32.58 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  30.14 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  47.79 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 474 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  51.33 
 
 		 455 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  31.21 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00602  minor lipoprotein  29.86 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0208162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0653  rare lipoprotein A  29.86 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000226966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00591  hypothetical protein  29.86 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0164207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  29.86 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0658  rare lipoprotein A  29.86 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2993  rare lipoprotein A  29.86 
 
 		 362 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3012  rare lipoprotein A  29.86 
 
 		 362 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000245758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  43.54 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  39.05 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  43.15 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  30.92 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 468 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  30.92 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0721  rare lipoprotein A  29.58 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000475341  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  47.66 
 
 		 421 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  47.66 
 
 		 419 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  47.97 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  49.15 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  50 
 
 		 195 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  44.8 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  49.02 
 
 		 212 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  46.73 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0798  rare lipoprotein A  30.59 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00108325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 194 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  50.89 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  36.56 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  48.62 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.62 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  47.33 
 
 		 169 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  99.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  40.48 
 
 		 398 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  40.24 
 
 		 394 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  46.88 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  47.22 
 
 		 265 aa  99  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 263 aa  99  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  40.15 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  44.64 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1168  rare lipoprotein A  31.85 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  44.92 
 
 		 163 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  38.69 
 
 		 169 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  29.64 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  35.35 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  33.45 
 
 		 284 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  40.94 
 
 		 154 aa  96.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  32.81 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  42.75 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  44.95 
 
 		 211 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>