117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0442 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  100 
 
 		 185 aa  383  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  62.3 
 
 		 192 aa  233  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  54.63 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  57.29 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  57.45 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  53.89 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  54.55 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  46.75 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  47.19 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  46.75 
 
 		 238 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  45.09 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  47.77 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  47.19 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  43.56 
 
 		 231 aa  187  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  43.56 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  43.56 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  48.55 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  41.15 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0005  cell division protein FtsN  41.62 
 
 		 177 aa  134  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  43.75 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  43.43 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  40.32 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2249  putative cell division protein FtsN  39.34 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  43.75 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  27.8 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  29.01 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  28.77 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  40.3 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  29.95 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  38.81 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  41.79 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  41.79 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  41.79 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  40.26 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  31.76 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  31.4 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  31.4 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  30.67 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  30.67 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  30.67 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  30.67 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  30.23 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  30.67 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  30.67 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  30.67 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  30.67 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  30.67 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  41.18 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  30.23 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  30.23 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  34.33 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  36.11 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  38.81 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  27.69 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  29.33 
 
 		 297 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  29.33 
 
 		 297 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  38.81 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  38.81 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  38.81 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  29.33 
 
 		 301 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  38.81 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  38.81 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  38.81 
 
 		 319 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  38.81 
 
 		 319 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  38.81 
 
 		 319 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  37.31 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  37.31 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  37.31 
 
 		 334 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  37.31 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  37.31 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  32.18 
 
 		 257 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  35.53 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  31.43 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  37.31 
 
 		 344 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  32.84 
 
 		 257 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  33.8 
 
 		 248 aa  51.2  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  31.01 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  31.58 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  30.26 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  33.8 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  26.64 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  25.97 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  25.26 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  35.48 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  28.77 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  28.17 
 
 		 245 aa  47.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1124  cell division protein FtsN  32.31 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.1824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  28.17 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  32.93 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  25.42 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  25.58 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  26.67 
 
 		 232 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  28.17 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  28.17 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 		 232 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  28.17 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>