61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1124 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1124  cell division protein FtsN  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.1824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  25 
 
 
319 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  25.29 
 
 
281 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  25.29 
 
 
281 aa  88.2  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  25 
 
 
319 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  25 
 
 
319 aa  88.2  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  25 
 
 
319 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  25.17 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  25 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  25.17 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  25 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  25 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  25.2 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  23.62 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  23.62 
 
 
257 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  38.89 
 
 
324 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  38.89 
 
 
334 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  38.89 
 
 
325 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  38.89 
 
 
324 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  38.89 
 
 
328 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  36.62 
 
 
344 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  33.33 
 
 
312 aa  58.9  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  25.85 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  30.56 
 
 
280 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  38.67 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  27.42 
 
 
176 aa  55.1  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  33.8 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  29.17 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  33.77 
 
 
264 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  24.58 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  33.06 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  23.3 
 
 
191 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0005  cell division protein FtsN  32.14 
 
 
177 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  24.51 
 
 
198 aa  48.5  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  29.58 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  31.63 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  42.22 
 
 
144 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  32.99 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 
190 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  39.58 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  32.43 
 
 
265 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  24.69 
 
 
188 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  31.15 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  22.98 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  37.78 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  29.82 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 
292 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 
295 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  30 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 
298 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 
301 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  27.03 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  34.55 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  23.72 
 
 
231 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  30.77 
 
 
274 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  28.38 
 
 
265 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  31.51 
 
 
224 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  23.72 
 
 
231 aa  41.6  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  30.77 
 
 
282 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>