67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0199 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  28.33 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  24.6 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  28.47 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  27.69 
 
 
185 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  34.72 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  33.78 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  31.87 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  31.33 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  22.33 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  33.33 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  33.33 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  31.94 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 
297 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 
295 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  34.72 
 
 
297 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  23.48 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 
301 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  23.48 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  34.72 
 
 
301 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 
298 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  26.36 
 
 
199 aa  49.3  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  25.26 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  23.67 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  31.09 
 
 
198 aa  48.9  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  29.6 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  30.56 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  23.61 
 
 
238 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  30.56 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  30.14 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  24.03 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  29.49 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  28.26 
 
 
264 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  23.3 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  27.14 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  30.14 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  38.71 
 
 
289 aa  45.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  29.17 
 
 
236 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  29.17 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  25.37 
 
 
201 aa  45.1  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  33.33 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  29.17 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  29.73 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  25.9 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  27.78 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  22.88 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  35.62 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  29.49 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  30.56 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  22.94 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  22.89 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  36.07 
 
 
168 aa  42  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  30 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  27.03 
 
 
303 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>