110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0455 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  97.84 
 
 
231 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  90.48 
 
 
231 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  75.85 
 
 
230 aa  344  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  70.9 
 
 
238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  70.9 
 
 
238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  72.2 
 
 
238 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  71.9 
 
 
238 aa  333  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  51.98 
 
 
192 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  49.11 
 
 
199 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  50.44 
 
 
198 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  51.98 
 
 
190 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  50.22 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  48.67 
 
 
191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  46.02 
 
 
185 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  40.41 
 
 
176 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0005  cell division protein FtsN  36.53 
 
 
177 aa  121  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  34.21 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  49.07 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  31.58 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  52.63 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  42 
 
 
144 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2249  putative cell division protein FtsN  29.57 
 
 
183 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  35.06 
 
 
281 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  35.06 
 
 
281 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  35.06 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  33.77 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  27.31 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  27.57 
 
 
186 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  30.4 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  34.67 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  26.87 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  26.87 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  29.01 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  30.16 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  32 
 
 
279 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  34.33 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  34.33 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  40.91 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  34.33 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  32.11 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  36.23 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  27.07 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  31.34 
 
 
282 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  32.84 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  24.55 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  31.34 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  31.34 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  31.34 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  31.34 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  31.34 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  31.34 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  31.34 
 
 
286 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  31.34 
 
 
301 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 
295 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 
298 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 
301 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  31.34 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  44.23 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  34.78 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  31.51 
 
 
319 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  31.51 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  31.51 
 
 
284 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  31.51 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  31.51 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  33.75 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  31.51 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  31.51 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  31.51 
 
 
284 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  31.51 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  31.51 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  34.33 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  29.33 
 
 
328 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  29.33 
 
 
325 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  29.33 
 
 
334 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  29.33 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  29.33 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  34.78 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  34.78 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  30 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  30 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  32.56 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  27.12 
 
 
238 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  26.91 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  25.13 
 
 
177 aa  48.5  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  29.81 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  37.5 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  34.33 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  30.38 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  31.82 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  32 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  34.85 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  32.84 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  34.85 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  32.35 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  33.78 
 
 
198 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>