143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0152 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  46.49 
 
 
218 aa  184  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  50.24 
 
 
208 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  50.7 
 
 
208 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  47.42 
 
 
211 aa  178  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  43.27 
 
 
245 aa  167  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  49.04 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  52.83 
 
 
213 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  41.01 
 
 
225 aa  158  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  44.44 
 
 
229 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  35.37 
 
 
236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  35.62 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  36.67 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  32.82 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  32.14 
 
 
260 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  34.31 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  36.1 
 
 
204 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  56.06 
 
 
289 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  35.37 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  45.26 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  45.24 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  45.24 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  45.24 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  45.24 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  45.24 
 
 
286 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  45.24 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  45.24 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
298 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  48 
 
 
297 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
295 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
297 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  46.67 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  48 
 
 
301 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  27.59 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  42.47 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  36.49 
 
 
303 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  33.78 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  26.67 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  33.07 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  34.78 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  28.38 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  41.43 
 
 
312 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  28.92 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  34.72 
 
 
346 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  34.29 
 
 
290 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  36.36 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  36 
 
 
315 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  38.57 
 
 
248 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  38.57 
 
 
281 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  38.57 
 
 
281 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  38 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2249  putative cell division protein FtsN  34.67 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  35.71 
 
 
279 aa  48.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0348  Sporulation domain protein  27.52 
 
 
277 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647009  normal  0.768364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  30.38 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0168  hypothetical protein  27.52 
 
 
296 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  29.67 
 
 
201 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  41.1 
 
 
228 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  30.38 
 
 
231 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  30.38 
 
 
231 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  29.11 
 
 
230 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  36.36 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  36.99 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  32 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  32.39 
 
 
268 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  34.29 
 
 
280 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  31.94 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  29.11 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  36.07 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  30.56 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  26.67 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  28.17 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 
280 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  40 
 
 
260 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  36.21 
 
 
256 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  30.56 
 
 
264 aa  45.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  36.36 
 
 
144 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  29.58 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  30.14 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  32.93 
 
 
342 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  28.74 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  33.73 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  27.1 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  33.87 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  30.99 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  30.38 
 
 
352 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  26.76 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  27.1 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  29.23 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  29.11 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  29.58 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>