102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02506 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  54.29 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  53.41 
 
 
328 aa  309  5e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  84.81 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  35.93 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  43.42 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  36.42 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  38.03 
 
 
210 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  36.3 
 
 
215 aa  60.1  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  29.73 
 
 
194 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  30.97 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  34.07 
 
 
204 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  34.29 
 
 
240 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  34.29 
 
 
240 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  34.27 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  33.58 
 
 
223 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  38.89 
 
 
268 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  39.74 
 
 
228 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  38.18 
 
 
223 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  32.87 
 
 
262 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  29.87 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  34.09 
 
 
709 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  25.31 
 
 
205 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  25.31 
 
 
203 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  34.25 
 
 
205 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  26.87 
 
 
174 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 
250 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  37.66 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  40.85 
 
 
280 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  27.93 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  40.54 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  38.81 
 
 
533 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  37.96 
 
 
225 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  39.44 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  27.38 
 
 
265 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  30.12 
 
 
250 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  29.33 
 
 
186 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  31.94 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  31.16 
 
 
281 aa  50.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  42.62 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  28.41 
 
 
203 aa  49.7  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  28.28 
 
 
279 aa  49.7  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  30.14 
 
 
221 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  35.53 
 
 
325 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  43.08 
 
 
290 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  31.37 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  33.94 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  36.08 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  33.8 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2162  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
1048 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  27.94 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  29.07 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  33.8 
 
 
219 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  31.3 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  31.3 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  29.61 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3497  sporulation domain-containing protein  31.98 
 
 
352 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  39.29 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  38.89 
 
 
229 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  39.06 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  32.88 
 
 
248 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  31.97 
 
 
224 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  38.32 
 
 
230 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  38.89 
 
 
424 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  29.09 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 
248 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  29.07 
 
 
246 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  31.97 
 
 
260 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  36.27 
 
 
255 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  31.25 
 
 
204 aa  46.2  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 
265 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  30.61 
 
 
224 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  37.5 
 
 
208 aa  46.2  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  27.52 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  29.63 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  34.41 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  32.54 
 
 
202 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  34.72 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  30.61 
 
 
224 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  30.61 
 
 
231 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  38.37 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  29.73 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  28.29 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  31.11 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  30.66 
 
 
238 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  35.21 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  30.34 
 
 
201 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  28.87 
 
 
224 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 
218 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  36.92 
 
 
209 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  27.84 
 
 
224 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  27.74 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3328  sporulation domain-containing protein  36.49 
 
 
263 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  32.74 
 
 
319 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  31.65 
 
 
274 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  37.66 
 
 
249 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  35.06 
 
 
328 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  35.06 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>