89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2148 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  100 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  47.98 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  43.54 
 
 		 265 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  47.5 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  43.93 
 
 		 274 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  43.75 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  44.41 
 
 		 274 aa  184  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  46.36 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  41.55 
 
 		 281 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  44.19 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  44.78 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  44.62 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  44.62 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  44.93 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  43.85 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  45.41 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  37.67 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  38 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  38 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  35.5 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  38.6 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  36.86 
 
 		 245 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  37.39 
 
 		 233 aa  127  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  38.2 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  36.58 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  36.32 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  37.34 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  37.34 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  35.46 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  36.1 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  35.96 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  32.63 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  34.39 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  36.94 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  36.73 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  34.39 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  33.93 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  43.52 
 
 		 275 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  30.3 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  26.91 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  29.61 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  29.02 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  38.16 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  36.84 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  36.84 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  26.07 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  36.36 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  35.53 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  35.53 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  32.89 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  24.31 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  37.5 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  28.84 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  33.64 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.45 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  38.89 
 
 		 346 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  35.53 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  24.24 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  34.25 
 
 		 424 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  22.75 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  30.86 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.27 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  24.88 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  33.75 
 
 		 328 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1500  Sporulation domain protein  36.25 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  33.75 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  26.34 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25.25 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  37.84 
 
 		 267 aa  45.1  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  35.35 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  43.4 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  33.8 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  31.58 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  32.32 
 
 		 574 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  32.32 
 
 		 574 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  30.95 
 
 		 257 aa  42  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 		 271 aa  42  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  27.38 
 
 		 168 aa  41.6  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>