85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  90.87 
 
 		 219 aa  339  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  60.81 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  58.99 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  58.53 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  57.14 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  58.74 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  58.56 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  56.25 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  57.27 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  52.29 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  31.67 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  31.67 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  31.44 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  28.02 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  29.11 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  29.74 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  29.17 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  36.99 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  27.49 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  30.52 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.57 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  28.37 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  29.25 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  27.6 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  25.87 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  28.02 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  26.97 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  29.52 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  25.71 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  26 
 
 		 250 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  24.77 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  25.36 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  26.07 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  28.57 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  26.22 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  24.03 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  25.46 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  26.79 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  24.31 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  22.97 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  25.49 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  24.4 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  24.4 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  24.17 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  25.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  28.83 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  28.33 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  26.87 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  28.32 
 
 		 281 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.34 
 
 		 2449 aa  48.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  31.48 
 
 		 324 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  31.48 
 
 		 324 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  31.48 
 
 		 334 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  31.48 
 
 		 325 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  31.48 
 
 		 328 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  29.23 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  27.92 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  33.8 
 
 		 345 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  27.92 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  29.23 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  32.86 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  29.23 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  30.93 
 
 		 319 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  27.5 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  26.85 
 
 		 938 aa  46.2  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  34.23 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  25.55 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  27.73 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  27.73 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  27.7 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  27.73 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  27.73 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  27.73 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  27.73 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  27.73 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  27.73 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  81.82 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  27.08 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  33.33 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  30.97 
 
 		 709 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  34.72 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  25.44 
 
 		 1888 aa  42  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  34.67 
 
 		 344 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  59.26 
 
 		 328 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>