63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2572 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  100 
 
 
275 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  67.93 
 
 
285 aa  347  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  58.91 
 
 
250 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  54.84 
 
 
249 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  52.52 
 
 
245 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  52.16 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  52.16 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  51.27 
 
 
233 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  88.24 
 
 
246 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  38.91 
 
 
221 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  34.39 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  69.66 
 
 
224 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  34.59 
 
 
265 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  35.25 
 
 
250 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  68.54 
 
 
224 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  34.84 
 
 
281 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  68.89 
 
 
224 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  68.89 
 
 
224 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  68.48 
 
 
224 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  34.81 
 
 
274 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  34.54 
 
 
274 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  34.38 
 
 
250 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  33.45 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  33.11 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  33.11 
 
 
250 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  32.23 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  33.09 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  43.52 
 
 
223 aa  85.5  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  44.19 
 
 
201 aa  85.5  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  46.67 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  40.2 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  55.38 
 
 
197 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  37.8 
 
 
208 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  40 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  45.78 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 
205 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  36.49 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  34.91 
 
 
204 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  31.76 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  27.17 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  27.48 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  38.96 
 
 
214 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  38.03 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  38.03 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  30.26 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  30.26 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  29.82 
 
 
186 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  32.48 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  32.5 
 
 
271 aa  45.8  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  33.85 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  32 
 
 
346 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  30.56 
 
 
345 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  22.64 
 
 
223 aa  42  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>