68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1372 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  100 
 
 
285 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  67.93 
 
 
275 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  54.48 
 
 
246 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  55.59 
 
 
245 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  54.55 
 
 
240 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  54.55 
 
 
240 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  51.7 
 
 
249 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  50.18 
 
 
233 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  84.71 
 
 
250 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  38.38 
 
 
281 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  38.24 
 
 
274 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  39.58 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  34.69 
 
 
259 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  38.54 
 
 
265 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  34.51 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  35.21 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  32.04 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  33.1 
 
 
232 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  32.87 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  32.87 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  70.24 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  65.26 
 
 
224 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  63.92 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  70.37 
 
 
224 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  70.37 
 
 
224 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  70.37 
 
 
224 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  44.36 
 
 
221 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  28.01 
 
 
203 aa  95.9  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  44.68 
 
 
201 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  28.37 
 
 
204 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  31.55 
 
 
205 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  50.51 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  48.24 
 
 
198 aa  79  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  39 
 
 
214 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  36.51 
 
 
223 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  36.67 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  36.76 
 
 
206 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  35.83 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  41.33 
 
 
214 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  37.21 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  36.62 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  36.62 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  34.18 
 
 
271 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  31.67 
 
 
215 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  28.95 
 
 
203 aa  45.8  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  28.95 
 
 
205 aa  45.8  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  26.57 
 
 
255 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  31.37 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  29.23 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  29.23 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  44.68 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  27.66 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  30.77 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  24.91 
 
 
221 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  27 
 
 
186 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  30.86 
 
 
345 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  29.56 
 
 
332 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  31.62 
 
 
239 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  37.5 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>