42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1297 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  517  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  94.53 
 
 
256 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  23.14 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  25.51 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  27.94 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  24.71 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  24.19 
 
 
209 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  24.56 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  26.25 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  26.81 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  24.32 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  24.32 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  26.18 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  25.88 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  27.82 
 
 
259 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  27.3 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  24.89 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  26.26 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  26.21 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  23.98 
 
 
221 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  25.89 
 
 
203 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  25.2 
 
 
214 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  22.09 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  28.67 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  31.33 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  36.11 
 
 
205 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  22.86 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  30.99 
 
 
203 aa  45.8  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  30.99 
 
 
205 aa  45.8  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  24.08 
 
 
224 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  25 
 
 
189 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  24.89 
 
 
232 aa  45.4  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  30.99 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  31.94 
 
 
307 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  22.86 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  32.63 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  32.39 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  22.04 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  22.45 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  23.35 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  27.85 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1018  sporulation domain-containing protein  42.62 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0660774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>