75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2046 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
186 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  59.15 
 
 
140 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  30.21 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  30.61 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  28.79 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  34.29 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  34.29 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  27.23 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  31.43 
 
 
205 aa  61.6  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  27.14 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  32.86 
 
 
216 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  32.86 
 
 
216 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  35.4 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  32.86 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  29.93 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  32.1 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  30 
 
 
215 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  24.5 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  30 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  26.53 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  32.5 
 
 
228 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  26.92 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  30.41 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  34.25 
 
 
259 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  27.42 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  30.77 
 
 
232 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  28.57 
 
 
224 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  28.22 
 
 
204 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.59 
 
 
174 aa  51.2  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  25.67 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  32 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  25.84 
 
 
233 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  33.68 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  23.32 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  31.16 
 
 
274 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  29.82 
 
 
275 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  28.38 
 
 
218 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  30.23 
 
 
740 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  29.51 
 
 
256 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  26.05 
 
 
240 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  26.05 
 
 
240 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  28.16 
 
 
245 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  30.14 
 
 
267 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  27.03 
 
 
328 aa  44.7  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  31.03 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  27.03 
 
 
328 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  24.18 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  31.9 
 
 
274 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  24.18 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  30.86 
 
 
574 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  30.43 
 
 
262 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  25.29 
 
 
261 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  25.25 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  29.63 
 
 
574 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  27.4 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  27 
 
 
285 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  27.27 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  23.08 
 
 
224 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  26.14 
 
 
250 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  26.7 
 
 
279 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  29.27 
 
 
228 aa  41.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  34.55 
 
 
230 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  26.14 
 
 
224 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  25.35 
 
 
345 aa  41.2  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>