75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1481 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
274 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  95.62 
 
 
274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  90.15 
 
 
265 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  79.79 
 
 
281 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  70.61 
 
 
259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  62.77 
 
 
250 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  63.04 
 
 
250 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  60.92 
 
 
250 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  60.92 
 
 
250 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  42.28 
 
 
221 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  42.55 
 
 
223 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  42.61 
 
 
232 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  42.96 
 
 
206 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  41.49 
 
 
208 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  39.58 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  36.03 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  36.4 
 
 
240 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  36.4 
 
 
240 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  35.05 
 
 
249 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  34.83 
 
 
250 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  34.81 
 
 
275 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  32.71 
 
 
214 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  33.95 
 
 
224 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  34.44 
 
 
233 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  59.76 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  32.97 
 
 
197 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  30.48 
 
 
203 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  30.04 
 
 
197 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  57.69 
 
 
201 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  27.68 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  42.71 
 
 
189 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  47.83 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  42.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  40.95 
 
 
198 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  27.97 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  25.76 
 
 
214 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  25.99 
 
 
256 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  25.66 
 
 
214 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  25.63 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25.41 
 
 
223 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  25.56 
 
 
216 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  30.89 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  33.33 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  35.29 
 
 
217 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  28.34 
 
 
215 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  34.12 
 
 
216 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  38.22 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  30.49 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  31.71 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  25.09 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  31.71 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  33.04 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  27.71 
 
 
424 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  31.16 
 
 
186 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  30.14 
 
 
221 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  27.64 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  27.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  30.41 
 
 
313 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  46.15 
 
 
1249 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  38.46 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  32.14 
 
 
254 aa  42.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>