70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002877 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  86.8 
 
 		 197 aa  341  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  65.66 
 
 		 198 aa  254  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  51.74 
 
 		 189 aa  184  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  35.62 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  38.1 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  37.21 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  34.51 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  34.96 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  34.51 
 
 		 224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  34.07 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  31.93 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  35.63 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  34.54 
 
 		 249 aa  114  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  35.58 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  34.38 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  35.78 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  34.11 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  34.09 
 
 		 265 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  33.46 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  33.93 
 
 		 281 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  34.95 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  33.8 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  32.97 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  31.5 
 
 		 274 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  34.14 
 
 		 250 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  34.54 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  34.98 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  34.26 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  33.77 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  33.86 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  32.21 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  50.51 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  57.33 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  46.67 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  25.24 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  25.12 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  25.91 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  26.13 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  25.19 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  25.45 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  25.99 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  27.42 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.65 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25.82 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  34.25 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  26.17 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  31.51 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  28.07 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  30.14 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  30.14 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  28.77 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0807  sporulation related  27.84 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  30.77 
 
 		 424 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  28.44 
 
 		 215 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  22.68 
 
 		 574 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.12 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  25.81 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>