82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1998 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  100 
 
 
214 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  98.6 
 
 
214 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  91.2 
 
 
216 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  78.28 
 
 
221 aa  331  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  58.99 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  60.35 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  57.87 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  58.82 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  59.73 
 
 
217 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  57.01 
 
 
204 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  54.63 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 
223 aa  84.7  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  33.19 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  26.76 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  32.17 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  30.05 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  28.77 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  28.37 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  29.15 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  29.03 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  28.5 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  28.96 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  30.05 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  26.44 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  27.27 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  30.7 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  22.33 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  27.31 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  27.31 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  27.34 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  27.67 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  27.38 
 
 
265 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  28.37 
 
 
198 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  26.92 
 
 
189 aa  61.6  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  25.69 
 
 
250 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  26.42 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  27.44 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  27.4 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  25.69 
 
 
250 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  25.12 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  25.82 
 
 
281 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.11 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  27.46 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  24.62 
 
 
262 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  24.9 
 
 
256 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  28.7 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  27.4 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  25.78 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  35.58 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  28.11 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0807  sporulation related  23.79 
 
 
204 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  26.64 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  26.61 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 
140 aa  48.5  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  26.64 
 
 
224 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  26.64 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  26.64 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  28.21 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  28.21 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  34.31 
 
 
248 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  52.08 
 
 
346 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  34.31 
 
 
281 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  34.31 
 
 
281 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  27.69 
 
 
231 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  28.44 
 
 
261 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  46.81 
 
 
328 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  36.71 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.97 
 
 
2449 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  46.81 
 
 
328 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  32.35 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  23.36 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  25.72 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1639  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 
276 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  32.77 
 
 
319 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  35.48 
 
 
228 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1500  Sporulation domain protein  39.62 
 
 
262 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  25.6 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  30.95 
 
 
709 aa  41.6  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  24.31 
 
 
245 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  24.41 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  24.41 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>