73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3813 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  88.07 
 
 		 217 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  64.29 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  56.56 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  56.96 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  55.65 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  53.88 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  59.46 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  57.08 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  56.48 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  56.19 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  35.24 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  28.57 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  28.57 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  28.51 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  30.33 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  32.11 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  29.78 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  30.59 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  27.91 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  29.44 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  26.91 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  25.98 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  26.57 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  28.91 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.11 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  26.34 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  29.72 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  27.41 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  27.82 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  25.5 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  28.84 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  27.54 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  28.16 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  22.83 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  26.94 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  34.07 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  26.87 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  26.36 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  27.78 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  24.61 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  40.54 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  26.94 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  26.27 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  26.94 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  26.58 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  24.12 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  34.29 
 
 		 140 aa  48.9  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  23.41 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  25.52 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  25.1 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  25.54 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  24.35 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  24.56 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  26.11 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  24.69 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  38.3 
 
 		 277 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  30.47 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  30.47 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  30.47 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  30.47 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  23.89 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  35.92 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  27.75 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  32.97 
 
 		 324 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  41.94 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 709 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  38.6 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  43.75 
 
 		 328 aa  42  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  43.75 
 
 		 328 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>