64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3330 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  474  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  65.06 
 
 
240 aa  289  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  65.06 
 
 
240 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  64.68 
 
 
245 aa  288  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  55.09 
 
 
285 aa  260  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  56.99 
 
 
275 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  59.46 
 
 
250 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  58.3 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  57.83 
 
 
246 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  56.1 
 
 
224 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  55.69 
 
 
224 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  55.28 
 
 
224 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  51.63 
 
 
224 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  54.88 
 
 
224 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  51.82 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  40.88 
 
 
265 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  37.84 
 
 
259 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  40.36 
 
 
274 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  38.15 
 
 
221 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  39.71 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  38.25 
 
 
281 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 
201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 
206 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  36.29 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  35.25 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  35.74 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  36.95 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  33.72 
 
 
250 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  33.72 
 
 
250 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  32.93 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  32.79 
 
 
208 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  35.71 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  34.54 
 
 
197 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  30.4 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  34.41 
 
 
198 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  31.05 
 
 
204 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  29.02 
 
 
214 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  54.17 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  34.15 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  25.1 
 
 
218 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  26.45 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  25.32 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  30.63 
 
 
313 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  29.78 
 
 
332 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  34.38 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  28.93 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  55.93 
 
 
489 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  32.08 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  28.37 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  57.14 
 
 
444 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  32.08 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  28.37 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.58 
 
 
174 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  30.29 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  28.38 
 
 
345 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  53.03 
 
 
484 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>