71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03097 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  390  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  86.8 
 
 
197 aa  341  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  65.15 
 
 
198 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  52.74 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  36.84 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  39.62 
 
 
205 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  37.14 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  34.33 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  34.39 
 
 
223 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  34.3 
 
 
209 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  32.93 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  37.61 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  32.68 
 
 
259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  34.31 
 
 
240 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  34.31 
 
 
240 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  31.33 
 
 
224 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  33.2 
 
 
245 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  34.7 
 
 
206 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  31.33 
 
 
224 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  31.33 
 
 
224 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  31.33 
 
 
224 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  32.02 
 
 
250 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  32.02 
 
 
250 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  32.14 
 
 
281 aa  104  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  31.82 
 
 
265 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  36.06 
 
 
203 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  30.04 
 
 
274 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  32.02 
 
 
250 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  31.33 
 
 
250 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  32.39 
 
 
214 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  31.47 
 
 
232 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  31.78 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  30.04 
 
 
274 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  58.33 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  59.72 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  50 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  55.38 
 
 
275 aa  77  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  26.73 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.73 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  25.68 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  26.42 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  26.32 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  26.79 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  26.53 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  25.28 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.25 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  34.25 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  31.51 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  30.14 
 
 
216 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  23.44 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0807  sporulation related  28.93 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  30.14 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  28.77 
 
 
224 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  32.05 
 
 
424 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  28.77 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  24.2 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  26.42 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  22.16 
 
 
574 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  22.16 
 
 
574 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  26.53 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>