69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3800 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  100 
 
 
204 aa  400  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  38.35 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  37.2 
 
 
203 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  35.21 
 
 
214 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  36.19 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  34.86 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 
206 aa  111  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  33.49 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  34.42 
 
 
201 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  33.47 
 
 
240 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  33.47 
 
 
240 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  33.48 
 
 
223 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  32.78 
 
 
245 aa  104  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  31.9 
 
 
232 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  34.48 
 
 
224 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  32.1 
 
 
233 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  33.2 
 
 
249 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  31.78 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  31.02 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  32.21 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  28.79 
 
 
259 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  32.87 
 
 
198 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  28.37 
 
 
285 aa  88.2  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  27.94 
 
 
250 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  27.94 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  27.94 
 
 
250 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  26.47 
 
 
274 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  29.96 
 
 
250 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  27.86 
 
 
265 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  27.6 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  28.21 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  28.21 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  27.68 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  28.21 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  35.9 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  34.91 
 
 
275 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.81 
 
 
174 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  61.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  32.91 
 
 
246 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  26.92 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.92 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  33.65 
 
 
281 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  24.02 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  23.42 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  28.22 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  24.65 
 
 
223 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  24.88 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  25.36 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  22.07 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  25.46 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  33.77 
 
 
574 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  32.47 
 
 
574 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  28.14 
 
 
239 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  31.25 
 
 
267 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  21.17 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  21.39 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  34.04 
 
 
346 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  25.35 
 
 
345 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  30 
 
 
168 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  30.99 
 
 
254 aa  41.2  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  21.68 
 
 
224 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>