61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1967 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  42.03 
 
 
189 aa  138  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  34.12 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  38.05 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  39.62 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  33.18 
 
 
221 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  37.21 
 
 
197 aa  121  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  35.24 
 
 
206 aa  121  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  36.09 
 
 
223 aa  121  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  32.1 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  36.45 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  31.14 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  36.19 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  32.78 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  33.18 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  31.84 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  30.74 
 
 
224 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  31.54 
 
 
265 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  31.84 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  30.61 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  33.04 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  30.61 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  31.87 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  30.09 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  30.22 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  30.3 
 
 
224 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  33.09 
 
 
281 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  32.13 
 
 
220 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  35.55 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  29.27 
 
 
249 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  31.25 
 
 
203 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  31.55 
 
 
285 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
274 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  39.13 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  38.89 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  38.89 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  36.36 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  29.91 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  29.91 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  25.68 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.13 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  25.82 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  32.05 
 
 
424 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  26.5 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  24.54 
 
 
223 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  25.62 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  30.39 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  32.5 
 
 
271 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  25.57 
 
 
219 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  30.67 
 
 
574 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  30.67 
 
 
574 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>