87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1607 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  47.3 
 
 		 203 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  37.05 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  35.34 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  33.94 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  35.2 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  35.2 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  34.54 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  33.96 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  32.36 
 
 		 274 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  32.71 
 
 		 274 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  33.46 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  33.73 
 
 		 259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  35.21 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  33.79 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  33.18 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  32.01 
 
 		 281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  29.22 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  29.22 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  33.8 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  29.32 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  29.54 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  31.14 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  32.42 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  33.95 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  32.75 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  31.48 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  27.71 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  27.71 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  27.63 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  27.27 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  28.63 
 
 		 249 aa  91.3  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  42.5 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  39 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  41.25 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  40 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  28.8 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  26.59 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  26.43 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  27.06 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.12 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  27.15 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  27.14 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  27.54 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  25.12 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  23.94 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  22.79 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  24.5 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  21.8 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  23.04 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  24.88 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  26.91 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  31.58 
 
 		 346 aa  48.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  21.92 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  35.29 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  24 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  21.62 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  29.73 
 
 		 345 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  32.38 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  24.9 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  27.62 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  31.65 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  27.62 
 
 		 280 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  31.25 
 
 		 290 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  45.1  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  31.08 
 
 		 574 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  31.08 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  31.17 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  29.69 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  31.97 
 
 		 709 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  29.73 
 
 		 574 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  41.67 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 		 328 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  34.25 
 
 		 328 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  35.94 
 
 		 332 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  28 
 
 		 140 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>