77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0523 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  65.66 
 
 
197 aa  254  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  65.15 
 
 
197 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  48.02 
 
 
189 aa  174  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  37.14 
 
 
221 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  35.06 
 
 
250 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  37.32 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  36.45 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  33.88 
 
 
246 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  33.73 
 
 
250 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  33.73 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  32.74 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  33.91 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  32.93 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  32.14 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  32.14 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  35.02 
 
 
240 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  32.64 
 
 
224 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  35.02 
 
 
240 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  33.47 
 
 
224 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  35.14 
 
 
223 aa  110  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  32.91 
 
 
232 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
206 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  31.53 
 
 
220 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  31.53 
 
 
220 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  31.53 
 
 
220 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  31.53 
 
 
220 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  31.53 
 
 
220 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  31.53 
 
 
220 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  31.53 
 
 
220 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  34.1 
 
 
208 aa  104  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  32.86 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  32.03 
 
 
259 aa  101  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  34.6 
 
 
203 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  31.48 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  32.87 
 
 
204 aa  92  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  30.82 
 
 
281 aa  91.3  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  48.24 
 
 
285 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  54.69 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  45.78 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  28.16 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  28.16 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  40.95 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  39.05 
 
 
265 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  26.57 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  25.23 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  25.12 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  32.05 
 
 
424 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  25.81 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25.47 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  26.44 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  30.14 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  28.77 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.12 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  30.14 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0807  sporulation related  28.57 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  25.24 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  23.33 
 
 
219 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  25.89 
 
 
221 aa  48.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  27.8 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  31.65 
 
 
267 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  26.03 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  25.25 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  28.72 
 
 
324 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  28.72 
 
 
324 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  28.72 
 
 
334 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  28.72 
 
 
325 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  28.72 
 
 
328 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  29.79 
 
 
319 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  25.71 
 
 
257 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  30 
 
 
332 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  30 
 
 
332 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>