78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2465 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  100 
 
 
220 aa  427  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  427  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  427  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  427  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  427  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  427  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  427  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  99.55 
 
 
220 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  99.55 
 
 
220 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  81.78 
 
 
224 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  82.14 
 
 
224 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  81.7 
 
 
224 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  81.25 
 
 
224 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  78.11 
 
 
233 aa  338  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  80.8 
 
 
224 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  56.28 
 
 
249 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  58.26 
 
 
240 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  58.26 
 
 
240 aa  225  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  57.14 
 
 
245 aa  224  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  49.09 
 
 
275 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  53.41 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  51 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  49.65 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  39.09 
 
 
221 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  38.84 
 
 
206 aa  141  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  36.73 
 
 
201 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  37.61 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  37.39 
 
 
197 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  38.3 
 
 
223 aa  128  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  37.78 
 
 
208 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  37.73 
 
 
197 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  34.5 
 
 
259 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  35.02 
 
 
274 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  35.75 
 
 
189 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  35.4 
 
 
198 aa  121  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  33.86 
 
 
250 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  34.87 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  34.21 
 
 
265 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  35.38 
 
 
274 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
250 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  34.77 
 
 
281 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  33.93 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
250 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
250 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  32.47 
 
 
214 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  31.86 
 
 
204 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  32.27 
 
 
203 aa  94  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  26.32 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.32 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  32.73 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.58 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  27.27 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  30.77 
 
 
255 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.56 
 
 
174 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  30.91 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  30.43 
 
 
280 aa  52  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  30.43 
 
 
280 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 
313 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  35.44 
 
 
290 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  27.73 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 
271 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  32.08 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  24.63 
 
 
267 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  30.05 
 
 
218 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  28.66 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  24.06 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  35.94 
 
 
332 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  28.64 
 
 
268 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  33.77 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  26.75 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  27.5 
 
 
424 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  26.48 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2162  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
1048 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1500  Sporulation domain protein  30.95 
 
 
262 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  27.19 
 
 
306 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  42.55 
 
 
315 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  32.81 
 
 
257 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  22.45 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>