More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0889 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1178    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  98.78 
 
 
574 aa  1170    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.87 
 
 
452 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.87 
 
 
452 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.63 
 
 
452 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.04 
 
 
457 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.75 
 
 
452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.23 
 
 
475 aa  269  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.44 
 
 
471 aa  266  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.44 
 
 
471 aa  266  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.76 
 
 
470 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.76 
 
 
471 aa  263  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.06 
 
 
472 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  34.99 
 
 
471 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.83 
 
 
472 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  34.01 
 
 
469 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.31 
 
 
471 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  34.97 
 
 
469 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.86 
 
 
470 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.61 
 
 
473 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.61 
 
 
473 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.48 
 
 
472 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.01 
 
 
468 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.87 
 
 
451 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.72 
 
 
445 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.11 
 
 
450 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.17 
 
 
456 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.17 
 
 
457 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.96 
 
 
450 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.64 
 
 
442 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.37 
 
 
441 aa  240  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.8 
 
 
450 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  31.63 
 
 
436 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  32 
 
 
437 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  31.63 
 
 
436 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.1 
 
 
607 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.76 
 
 
501 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.45 
 
 
658 aa  221  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  33.72 
 
 
430 aa  216  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  29.48 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.24 
 
 
609 aa  212  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 
440 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  30.64 
 
 
425 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  29.81 
 
 
423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.97 
 
 
431 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.16 
 
 
471 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.84 
 
 
636 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.97 
 
 
484 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.78 
 
 
451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.21 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.59 
 
 
466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.41 
 
 
484 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.98 
 
 
491 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.21 
 
 
444 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  28 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  27.69 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.7 
 
 
472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.73 
 
 
450 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.56 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.55 
 
 
566 aa  146  9e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  26.59 
 
 
559 aa  144  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.09 
 
 
524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.37 
 
 
472 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.52 
 
 
475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.08 
 
 
519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.45 
 
 
456 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 
450 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.76 
 
 
476 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.4 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.62 
 
 
538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.97 
 
 
489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.92 
 
 
464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 
463 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.29 
 
 
456 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  25.23 
 
 
425 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  24.54 
 
 
425 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.71 
 
 
450 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.77 
 
 
464 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.57 
 
 
494 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23 
 
 
487 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.11 
 
 
461 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.73 
 
 
462 aa  104  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.07 
 
 
483 aa  103  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 
518 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.88 
 
 
490 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.31 
 
 
472 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 
463 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.91 
 
 
472 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.99 
 
 
522 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.63 
 
 
497 aa  99.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3147  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 
495 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.88 
 
 
428 aa  98.2  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.57 
 
 
463 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.16 
 
 
455 aa  96.3  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.38 
 
 
472 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.82 
 
 
449 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.71 
 
 
461 aa  95.9  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.27 
 
 
456 aa  94.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.9 
 
 
441 aa  94  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.65 
 
 
460 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>