70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2439 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  73.06 
 
 
265 aa  345  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  71.33 
 
 
274 aa  344  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  70.61 
 
 
274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  66.08 
 
 
281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  63.36 
 
 
250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  63.74 
 
 
250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  60.22 
 
 
250 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  60.22 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  43.7 
 
 
221 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  44.44 
 
 
209 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  45.63 
 
 
232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  44.19 
 
 
206 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  43.24 
 
 
223 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  44.57 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  43.41 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  37.45 
 
 
249 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  34.69 
 
 
285 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  34.39 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  35.58 
 
 
245 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  34.94 
 
 
240 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  34.94 
 
 
240 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  33.73 
 
 
214 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  29.62 
 
 
250 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  34.12 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  31.32 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  33.46 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  32.68 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  31.87 
 
 
205 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  31.89 
 
 
203 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  31.42 
 
 
224 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  31.15 
 
 
224 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  31.09 
 
 
224 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  31.03 
 
 
224 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  32.03 
 
 
198 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  28.79 
 
 
204 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  46.99 
 
 
189 aa  82  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  46.38 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  29.82 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  43.24 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  27.45 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  24.25 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  31.33 
 
 
424 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  27.59 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  29.14 
 
 
332 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  34 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  28.79 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  27.87 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  30.77 
 
 
205 aa  48.9  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  30.77 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  22.49 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  26.05 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  32.94 
 
 
217 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  31.58 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  31.76 
 
 
216 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  31.58 
 
 
214 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  28.72 
 
 
254 aa  45.4  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.94 
 
 
841 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  41.94 
 
 
230 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  29.73 
 
 
345 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  31.58 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  31.58 
 
 
215 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>