87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1532 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  91.67 
 
 		 214 aa  351  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  90.28 
 
 		 214 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  78.28 
 
 		 221 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  59.91 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  57.14 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  57.41 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  56.56 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  57.41 
 
 		 204 aa  207  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  56.11 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  54.59 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  26.98 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  29.46 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  31.28 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  31.1 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  29.22 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  31.28 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  26.13 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  27.85 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  29.56 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  24.88 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  28.26 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  26.89 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  26.89 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  30.59 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  26.32 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  27.24 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  27.27 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  27.04 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  24.91 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  27.27 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  24.29 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  26.27 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  27.62 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  27.15 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  24.8 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  24.8 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  26.03 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  27.23 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  27.14 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  26.92 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  23.56 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  24.03 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  26.14 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  29.38 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0807  sporulation related  25.24 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  23.94 
 
 		 256 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  26.46 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  26.64 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0597  Sporulation domain protein  34.78 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  26.18 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.84 
 
 		 2449 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 		 140 aa  48.9  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  25.98 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  25.76 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  25.76 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  40.38 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  25.76 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  34.81 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  34.81 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  34.81 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  31.93 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  31.93 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  31.93 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  31.93 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  31.93 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  27.64 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  27.64 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  27.98 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  30.32 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  37.63 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  24.54 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  26.69 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  62.96 
 
 		 328 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  65.38 
 
 		 328 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  32.79 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35 
 
 		 1888 aa  42.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1500  Sporulation domain protein  39.62 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  22.27 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  24.28 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  25.17 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  23.46 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  25 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1639  sporulation repeat-containing protein  34.51 
 
 		 276 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  38.6 
 
 		 243 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  31.4 
 
 		 319 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>