89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2023 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  93.15 
 
 
215 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  61.26 
 
 
221 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  58.82 
 
 
214 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  57.92 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  57.4 
 
 
216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  59.21 
 
 
204 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  56.64 
 
 
216 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  55.51 
 
 
224 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  59.03 
 
 
217 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  52.8 
 
 
205 aa  178  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  30.18 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  30.22 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  33.33 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  29.15 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  29.28 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  29.91 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  29.78 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  34.7 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  30.88 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  27.57 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.42 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  27.27 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  28.7 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  26.19 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  24.63 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  28.3 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  26.48 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  28.64 
 
 
197 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  27.64 
 
 
267 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  26.32 
 
 
250 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  26.59 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  25.51 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  25.97 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  24.43 
 
 
265 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  22.97 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  25.84 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  27.52 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  25.1 
 
 
256 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  23.79 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  26.36 
 
 
262 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  23.79 
 
 
250 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  29.36 
 
 
232 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  23.85 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  33.04 
 
 
319 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  26.99 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  27.68 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  32.14 
 
 
284 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  32.14 
 
 
284 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  27.83 
 
 
281 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  24.88 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  32.14 
 
 
319 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  32.14 
 
 
319 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  32.14 
 
 
319 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  32.14 
 
 
319 aa  48.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  32.14 
 
 
319 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  32.14 
 
 
319 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  26.87 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  33.8 
 
 
345 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  33.78 
 
 
281 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  33.78 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  26.61 
 
 
224 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  32.86 
 
 
140 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  26.61 
 
 
224 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  33.78 
 
 
281 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  32.79 
 
 
709 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  35.29 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.23 
 
 
2449 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  25.75 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  26.18 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  25.21 
 
 
240 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  25.21 
 
 
240 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  25.21 
 
 
245 aa  45.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  36 
 
 
344 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  31.85 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  31.73 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  31.73 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  31.73 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  31.73 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  31.73 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  28.44 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  29.81 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  81.82 
 
 
346 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  27.27 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  28.93 
 
 
257 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  25.75 
 
 
224 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  34.72 
 
 
250 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  59.26 
 
 
328 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>