80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1605 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  100 
 
 
255 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  53.61 
 
 
332 aa  285  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  43.99 
 
 
313 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  53.56 
 
 
257 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  50 
 
 
271 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  49.82 
 
 
280 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  49.47 
 
 
280 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  43.98 
 
 
268 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  50.62 
 
 
315 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  64.42 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  36.78 
 
 
279 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  33.75 
 
 
215 aa  88.6  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  33.92 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  28.63 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  52.7 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  35.27 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  29.29 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  30.59 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  28.44 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  31.93 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  30.74 
 
 
223 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  29.02 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  29.53 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  28.74 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  30.87 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  26.79 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  28.11 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  27.78 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  31.62 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 
533 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  28.79 
 
 
274 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  28.79 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  29.96 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  35.9 
 
 
349 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  28.81 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  28.26 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  27.83 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  28.11 
 
 
203 aa  52.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  34.3 
 
 
214 aa  52  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  28.31 
 
 
285 aa  52  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  27.83 
 
 
224 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  36.28 
 
 
709 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  28.88 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  29.63 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  26.55 
 
 
208 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  25.79 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  28.06 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  26.34 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  25 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  29.41 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  29.59 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  29.29 
 
 
250 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  38.64 
 
 
278 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  25.23 
 
 
221 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  27.2 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  38.64 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  38.64 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  36.36 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  25.75 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  36.36 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  36.36 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  36.36 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  26.22 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  36.36 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  38.64 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
333 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  39.34 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  39.34 
 
 
310 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  36.59 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  38.64 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  37.08 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  31.86 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  22.98 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  27.09 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  27.09 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  26.58 
 
 
232 aa  42.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  34.25 
 
 
210 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  28.57 
 
 
312 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 
214 aa  42  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  31.67 
 
 
279 aa  42  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>