67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1424 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  97.96 
 
 
245 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  63.1 
 
 
249 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  54.55 
 
 
285 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  52.16 
 
 
275 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  53.12 
 
 
250 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  55.24 
 
 
246 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  55.83 
 
 
233 aa  224  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  54.2 
 
 
224 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  53.78 
 
 
224 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  53.78 
 
 
224 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  53.78 
 
 
224 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  53.16 
 
 
224 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  54.2 
 
 
220 aa  204  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  38.98 
 
 
221 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  34.36 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  36.4 
 
 
274 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  34.38 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  34.36 
 
 
250 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  34.36 
 
 
250 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  35.93 
 
 
265 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  37.3 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  38.32 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  34.72 
 
 
281 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  34.44 
 
 
201 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  36.71 
 
 
206 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  34.94 
 
 
259 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  35.68 
 
 
209 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  37.45 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  34.75 
 
 
189 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  32.77 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  35.02 
 
 
198 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  29.22 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  35.71 
 
 
197 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  34.31 
 
 
197 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  33.47 
 
 
204 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  32.77 
 
 
203 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  65.22 
 
 
331 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  68.18 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  26.67 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  48.9  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  50 
 
 
355 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  26.32 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  28.14 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  23.58 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  41.51 
 
 
1441 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  26.05 
 
 
186 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  49.09 
 
 
350 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
441 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  32.77 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  25.87 
 
 
328 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  28.12 
 
 
1612 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  34.09 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  26.25 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  33.73 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  25.17 
 
 
328 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  40.82 
 
 
315 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>