39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1673 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  335  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  22.84 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  24.42 
 
 
223 aa  58.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  22.01 
 
 
214 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  22.01 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.31 
 
 
203 aa  51.6  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  24.31 
 
 
205 aa  51.6  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
228 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  23.12 
 
 
204 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  22.96 
 
 
194 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.08 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  25.28 
 
 
201 aa  47.8  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  22.12 
 
 
221 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  25.42 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  30.26 
 
 
424 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  28.95 
 
 
267 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  20.41 
 
 
210 aa  45.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  30.95 
 
 
268 aa  44.7  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  26.76 
 
 
346 aa  44.3  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  31.82 
 
 
228 aa  44.3  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  27.4 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  44.9 
 
 
254 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  25.66 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0807  sporulation related  22.65 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  31.25 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  33.9 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  25.73 
 
 
204 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  36.07 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  27.78 
 
 
217 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
216 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  27.38 
 
 
223 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  20.38 
 
 
215 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  24.1 
 
 
197 aa  41.2  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.42 
 
 
286 aa  40.8  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  29.69 
 
 
248 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  40.8  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  25.29 
 
 
221 aa  40.8  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  26.39 
 
 
216 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>