148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1257 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  100 
 
 
218 aa  414  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  39.22 
 
 
194 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  30.96 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  35.87 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  32.33 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  29.7 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  29.7 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  33.48 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  31.03 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  34.26 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  29.82 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  34.27 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  28.1 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  28.81 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  34.11 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  31.08 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  27.31 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  43.42 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  28.32 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  33.04 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  25.4 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  40.79 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  31.4 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  27.62 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  29.13 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  29.44 
 
 
255 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  39.47 
 
 
328 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  29.67 
 
 
214 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  39.47 
 
 
328 aa  61.6  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  28.07 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  26.38 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  25.84 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.87 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  26.12 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  36.07 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  26.64 
 
 
265 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  36.27 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  28.84 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  29.56 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  25.1 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  27.78 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  25.17 
 
 
332 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  27.5 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  28.24 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  27.14 
 
 
274 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  28.26 
 
 
224 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  27.35 
 
 
224 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  23.32 
 
 
250 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  23.32 
 
 
250 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  27.54 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  34.15 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  26.1 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  24.49 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  27.64 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  30.94 
 
 
236 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  23.3 
 
 
204 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  36.25 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  45.21 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  34.86 
 
 
709 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  38.46 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  29.77 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  25.94 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  37.5 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  34.57 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  27.36 
 
 
279 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  28.03 
 
 
248 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2531  sporulation related protein  33.02 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.275195  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  39.33 
 
 
243 aa  48.5  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  24.5 
 
 
168 aa  48.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  25.9 
 
 
259 aa  48.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  34.65 
 
 
360 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  30.07 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  37.1 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  37.1 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  37.1 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  37.1 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  37.1 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  33.33 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  33.33 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  37.1 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  32 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  34.65 
 
 
360 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  67.86 
 
 
267 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
301 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1500  Sporulation domain protein  38.14 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
298 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  37.1 
 
 
301 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  35.71 
 
 
245 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  37.1 
 
 
297 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
297 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  23.72 
 
 
281 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1018  sporulation domain-containing protein  34.38 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0660774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  36.07 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  27.78 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>