16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1018 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1018  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0660774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1136  Sporulation domain protein  41.4 
 
 
244 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2303  sporulation domain-containing protein  34.22 
 
 
246 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00342773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  34.98 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  37.19 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1435  sporulation-related protein  35.48 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.419741  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  34.38 
 
 
256 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  34.16 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  29.45 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  37.93 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3376  Sporulation domain protein  42.31 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  34.38 
 
 
218 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  42.55 
 
 
198 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  40.32 
 
 
202 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  42.62 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  38.3 
 
 
256 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>