50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0901 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  653    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  98.78 
 
 
328 aa  644    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  56.76 
 
 
346 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  60.95 
 
 
345 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  41.3 
 
 
228 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  39.47 
 
 
218 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  30.48 
 
 
245 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  36.59 
 
 
210 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  28.93 
 
 
194 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  31.91 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  26.37 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  26.6 
 
 
203 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  35.63 
 
 
533 aa  49.3  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  36.36 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  37.21 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  37.21 
 
 
205 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  35.21 
 
 
254 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  33.75 
 
 
223 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  33.33 
 
 
239 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  46.48 
 
 
214 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  24.87 
 
 
268 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3711  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 
1143 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  40.3 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  37.7 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  38.1 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  37.7 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  55.88 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  46.81 
 
 
214 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  28.31 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  30.83 
 
 
231 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  30.83 
 
 
231 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  26.57 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  35.21 
 
 
228 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  27.03 
 
 
186 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  44.68 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  31.82 
 
 
229 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  24.07 
 
 
709 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  36.92 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  46.81 
 
 
214 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 
224 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  32.81 
 
 
268 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  66.67 
 
 
204 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  39.68 
 
 
211 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  38.57 
 
 
230 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3497  sporulation domain-containing protein  33.77 
 
 
352 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2287  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 
217 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.197916  normal  0.660885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  34.25 
 
 
214 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  25.87 
 
 
240 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  34.43 
 
 
278 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  25.87 
 
 
240 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>