122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1330 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  36.99 
 
 
218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  33.49 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.9 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  26.4 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  26.19 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  27.09 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  28.96 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  38.1 
 
 
709 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  25.33 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  25.12 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  31.43 
 
 
346 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  24.04 
 
 
209 aa  58.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  33.07 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  39.13 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  29.3 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  24.66 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  24.02 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  27.43 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  24.22 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  33.65 
 
 
360 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  28.93 
 
 
328 aa  55.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  33.65 
 
 
360 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  35.53 
 
 
345 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  40 
 
 
245 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25.11 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  35.53 
 
 
328 aa  54.7  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  24.55 
 
 
224 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  28.29 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  24.09 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  25.45 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  27.78 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  22.67 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  32.93 
 
 
424 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  23.64 
 
 
224 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  24.54 
 
 
224 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  27.35 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  37.14 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  37.14 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  37.14 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  32.26 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  38.67 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  37.84 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  26.5 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  22.88 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  23.22 
 
 
223 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  23.32 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  34.07 
 
 
254 aa  48.5  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  24.62 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  33.78 
 
 
290 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  28.74 
 
 
260 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  30.72 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  34.12 
 
 
360 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  27.8 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  26.09 
 
 
174 aa  47.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
271 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  23.58 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  23.58 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  28.42 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  23.64 
 
 
228 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  41.67 
 
 
289 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  25.64 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  26.92 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  32.91 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  32.93 
 
 
467 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3711  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
1143 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  23.38 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14360  Sporulation domain protein  26.32 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000686172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  23.85 
 
 
250 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  34.62 
 
 
224 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  35.48 
 
 
268 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  23.24 
 
 
221 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  22.69 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 
265 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  40.43 
 
 
206 aa  44.7  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  26.92 
 
 
236 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  28.77 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  30.26 
 
 
269 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  33.33 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  22.59 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  32.84 
 
 
256 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  24.87 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  30.23 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  23.3 
 
 
268 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  28.79 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  30.26 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  36.84 
 
 
278 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  36.84 
 
 
278 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
313 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  26.53 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>